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碱基编辑器效果好不好 机器学习模型能预测_科技频道_

发布日期:2020-07-31 02:21   来源:未知   阅读:

  • 本文转自【科技日报】;

    虽然碱基编辑器被广泛用于对基因进行定点编辑,但至今为止,我们对于碱基编辑器编辑效果的决定因素有哪些并不十分了解。美国哈佛大学刘如谦团队利用11个最受欢迎的碱基编辑器,对哺乳动物细胞中约3.8万个基因位点进行编辑的数据,创建了能精准预测碱基编辑器基因编辑效果的机器学习模型BE-Hive。研究人员发现,通过对3388个疾病相关单核苷酸突变的编辑的验证,发现BE-Hive预测准确率高达90%以上,甚至能准确预测出哪些等位基因不会被编辑。研究人员还利用BE-Hive模型,发现了某些碱基编辑器的“怪癖”??比如之前一般是将碱基C(胞嘧啶)变为T(胸腺嘧啶)的常规路线,有时会将碱基C变为G(鸟嘌呤)或A(腺嘌呤),从而帮助未来设计全新的碱基编辑工具,改进碱基编辑器的基因编辑能力。